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菌株篩選進入"刷臉時代":微觀圖像+拉曼光譜賦能菌落高效去重

來源:長春長光辰英生物科學儀器有限公司      分類:應用方案 2025-08-09 10:00:19 24閱讀次數(shù)
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活性污泥這座“微生物寶庫”蘊藏著無數(shù)功能菌株,
但傳統(tǒng)人工篩選效率低下、重復率高,
極大制約了其中微生物資源的開發(fā)。

創(chuàng)新研發(fā)的RAcolony高通量智能菌落篩選系統(tǒng),采用菌落"人臉識別"技術——融合菌落微觀圖像與拉曼光譜雙模態(tài)特征,實現(xiàn)菌落原位精準"刷臉認證"。
該系統(tǒng)智能剔除重復菌株,大大提升菌株篩選效率,為微生物資源開發(fā)開啟智能化新篇章!在污水處理、資源回收等領域展現(xiàn)極大的應用潛力。


一、應用優(yōu)勢


顛覆傳統(tǒng)|RAcolony高通量智能菌落篩選系統(tǒng):

1.雙模態(tài)"刷臉"去重:微觀圖像+拉曼光譜“人臉識別”技術,去重效率>95%;

2.日篩千菌:全自動高通量菌株篩選,加速構建菌種庫;

3.降本增效:智能高效篩選,大幅縮減周期和成本;

4.功能篩選:拉曼代謝指紋挖掘高價值菌株。

突破微生物資源開發(fā)瓶頸,為構建戰(zhàn)略菌種庫提供智能利器!

二、研究方法


1. 樣品制備:① 活性污泥均質(zhì)化處理(震蕩+超聲);② PBS梯度稀釋(10-3-10-5);③ 涂板培養(yǎng)(30℃, 24h);

2.全自動檢測:① 菌落宏觀成像精準定位和計數(shù);② 全皿菌落微觀成像;③ 菌落拉曼“分子指紋”檢測;

3.AI智能去重:① 圖像智能分析,22項菌落關鍵表型特征提取和相似性聚類;② 智能光譜分析:分子指紋特征提取和相似性聚類。

三、研究結果


圖1 RAcolony菌落智能識別對比

A) 原始菌落平皿宏觀圖;B) 智能計數(shù)和定位(373個菌落)


RAcolony系統(tǒng)基于旋轉(zhuǎn)分割算法精準計數(shù)10-5梯度平皿共有373個菌落,該結果與人工評估一致,為后續(xù)高效去重奠定基礎。

 

圖2 RAcolony去重篩選結果展示

A)“去重”后靶向13個菌落微觀圖像;B) 和C)對應菌落拉曼光譜信噪比和光譜。


圖2展示了RAcolony智能去重后的13個菌落的“人臉識別”信息,其微觀形態(tài)和拉曼光譜均呈現(xiàn)顯著差異,驗證了系統(tǒng)突出的去重性能。


圖3 RAcolony全皿去重篩選結果展示


RAcolony從全皿菌落中精準篩選13個目標菌株,經(jīng)自動挑取后全部擴培成功,驗證了系統(tǒng)的高效性與可靠性。


表1 RAcolony去重篩選菌株測序驗證

全皿共373個菌落,RAcolony菌落去重篩選13個菌落,覆蓋全皿80%的物種多樣性,并發(fā)現(xiàn)1株測序漏檢新菌種,效率明顯優(yōu)于人工方法。

四、結論


RAcolony高通量智能菌落篩選系統(tǒng)“刷臉認證”下的突破性表現(xiàn):

1)單皿375菌落智能分析,去重率高達96.5%

2)僅需挑取13個菌落即覆蓋全皿80%及以上的物種多樣性;

3)更發(fā)現(xiàn)傳統(tǒng)測序漏檢新菌種!

為環(huán)境微生物資源開發(fā)提供智能高效的解決方案。

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