光鑷+拉曼,打造發酵菌識別新平臺|Scatcher Ultra讓微生物快速檢測邁入單細胞時代
在乳制品、釀酒、食品工業中,發酵菌群的種類與動態直接影響產品風味與質量。然而傳統微生物檢測手段周期長、效率低、響應慢,難以滿足高效發酵工藝對“實時監控、快速鑒定”的新需求。
研發的Scatcher Ultra 單細胞拉曼光鑷分選儀,在多個微生物研究場景中展現出優秀的識別能力,在本研究中也應用于發酵菌快速識別中。Scatcher Ultra融合光鑷與拉曼光譜技術,構建了從單細胞精準操控、光譜采集到AI算法識別的全流程平臺,為復雜樣品中的發酵菌快速識別與定性提供了一種新型解決方案。
圖1 單細胞拉曼光鑷系統示意圖
圖a為單細胞拉曼光鑷系統專用芯片的設計示意圖;圖b為該芯片檢測區域的顯微成像
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· 無需染色標簽、無需熒光或抗體標記,保持細胞原始狀態
· 可擴展性強支持混菌樣品分析,驗證真實發酵環境中檢測可靠性
本應用以酸奶發酵過程為模型,分離獲得保加利亞乳桿菌、嗜熱鏈球菌等6種常見乳酸菌,搭建起了單細胞拉曼光鑷檢測與分類流程:
? 實驗步驟概覽:
01制備乳酸菌樣品并與納米銀顆粒(AgNPs)混合
02使用Scatcher Ultra平臺中的光鑷系統在微流控芯片中穩定捕獲細胞
03采集每種菌100條拉曼光譜
04訓練SVM與XGBoost分類模型,預測準確率>95%
? 結果亮點:
· 光鑷顯著增強SERS信號穩定性,標準差降低、信噪比上升
圖2 保加利亞乳桿菌信噪比統計
圖a為三組實驗(僅光鑷,僅SERS,光鑷+SERS)的信噪比標準差統計;圖b為三組實驗的信噪比數據分布圖
· 多種乳酸菌之間特征峰位差異清晰,如610、772、1176 cm-1等
圖3各類乳酸菌SERS拉曼信號分析
圖a為6種乳酸菌拉曼光譜t-SNE聚類結果;圖b為類植物乳桿菌的拉曼光
譜增強效果,b1為未經過SERS增強的拉曼光譜;圖c為6種乳酸菌的SERS光譜的均值方差圖
· 混菌樣本中也能成功識別出目標菌(預測準確率95%以上)
圖4 基于機器學習算法對6種乳酸菌構建分類識別模型
圖5 混合樣品SERS光譜與預測乳酸菌光譜比對
圖a為實驗菌種1與嗜熱鏈球菌光譜比對;圖b為實驗菌種2與保加利亞乳
桿菌光譜比對
相比傳統方法,Scatcher Ultra 在多個維度上表現亮眼:
1. 在液體中穩穩鎖定細胞,解決細胞漂浮、拉曼信號不穩定難題
2. 集成拉曼成像+機器學習分析,實現“所見即所判”
3. 不挑樣本、不限菌種,面對混菌或低豐度菌種依然表現出色。
借助Scatcher Ultra 單細胞拉曼光鑷分選儀,我們不僅實現了乳酸菌的快速、穩定識別,也為微生物發酵行業提供了更先進的檢測工具。未來,該平臺也有望在功能菌株篩選、環境樣本分析及難培養微生物研究等方向持續拓展應用邊界,推動微生物研究進入單細胞精細化時代。
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參考文獻:
Shang, L., Liang, P., Xu, L., Xue, Y., Liu, K., Wang, Y., ... & Li, B. (2023). Stable SERS detection of lactobacillus fermentum using optical tweezers in a microfluidic environment. Analytical chemistry, 96(1), 248-255.
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