細(xì)胞外囊泡在肺癌PD-L1免疫治療生物標(biāo)志物上的應(yīng)用
左圖:2020年十大Z常見(jiàn)癌癥中各種癌癥的新增比例和死亡比例1 。
右圖:Kaplan-Meier曲線估計(jì)治療組生存率,藍(lán)線:pembrolizumab抗體治療組,灰線:化療組2。
肺癌位居全球癌癥死亡數(shù)榜首和新增數(shù)第二位,而非小細(xì)胞肺癌(NSCLC)約占肺癌的80%。對(duì)于缺乏驅(qū)動(dòng)突變(如EGFR、 ALK)的晚期非小細(xì)胞肺癌(NSCLC)患者,免疫檢查點(diǎn)抑制劑(ICI),如針對(duì)程序性細(xì)胞死亡蛋白1(PD-1)和程序性細(xì)胞死亡配體1(PD-L1)的抗體,已經(jīng)徹底改變了肺癌治療的方式。
四種上市的 PD-L1 IHC 檢測(cè)方法,分別為 pembrolizumab、nivolumab、atezolizumab 和 durvalumab共同開(kāi)發(fā),并已被批準(zhǔn)作為相應(yīng)藥物的伴隨或補(bǔ)充診斷3。
迄今為止,通過(guò)免疫組化確定組織PD-L1(tPD-L1)的表達(dá)是唯一被批準(zhǔn)的免疫療法生物標(biāo)志物。然而,即使是tPD-L1低表達(dá)(1-49%)和缺失(<1%)的患者也可能從免疫療法中受益,但到目前為止,還沒(méi)有可靠的生物標(biāo)志物可以預(yù)測(cè)這類患者亞組的治療效果。
EVs介導(dǎo)細(xì)胞間通信
細(xì)胞外囊泡(EVs)或許就是解決這類難題的生物標(biāo)志物來(lái)源。這些小的膜顆粒由所有活細(xì)胞釋放,并通過(guò)攜帶特定的蛋白質(zhì)、脂質(zhì)和核酸(例如,DNA、RNA),從分泌細(xì)胞傳遞到周圍細(xì)胞,從而介導(dǎo)細(xì)胞間通信。腫瘤細(xì)胞同樣會(huì)向外周血液中排放數(shù)量眾多的EVs,將EVs作為新型癌癥生物標(biāo)志物在臨床常規(guī)檢測(cè)中具有廣闊的前景4。
近日,來(lái)自德國(guó)的研究人員在J Extracell Vesicles雜志上發(fā)表文章,報(bào)道了腫瘤相關(guān)的細(xì)胞外囊泡(EVs)用于預(yù)測(cè)tPD-L1低或缺失的患者對(duì)免疫療法的反應(yīng)5。
lEVs和sEVs的蛋白區(qū)別6
目前認(rèn)為有兩種不同的EV群體:直徑在50-150 nm之間的小EVs(sEVs,以前被稱為“外泌體”)和直徑在100-1000 nm之間的大EVs(lEVs,以前被稱為“微囊泡”)。由于lEVs體積較大,更易用于常見(jiàn)的診斷工具(如流式細(xì)胞術(shù))進(jìn)行分離和分析。該研究正是試圖選擇lEVs作為研究對(duì)象。
腫瘤抗原在lEV上高度表達(dá)。9種腫瘤抗原在5種NSCLC細(xì)胞系的細(xì)胞裂解物、lev或sev中的表達(dá)情況(僅展示H596一種細(xì)胞系結(jié)果)。actitin‐4作為lEV標(biāo)記物。
作者首先分離并表征了五種不同分子亞型 NSCLC 細(xì)胞系中腫瘤相關(guān)抗原在 lEV 和 sEV 上表達(dá)的差異。結(jié)果表明lEV上存在的全部腫瘤相關(guān)抗原,其中一些甚至比sEV的水平要高得多。確定了lEV作為后續(xù)研究的可能性。
從 NSCLC 患者血漿中分離的 lEV 和 sEV 的 電鏡照片(左)和NTA對(duì)比(右)結(jié)果,健康對(duì)照(CTLh)、非癌癥對(duì)照(CTLnc)和非小細(xì)胞肺癌患者。
作者接著從NSCLC患者血漿中分離出sEV和lEV,排除血漿脂蛋白對(duì)lEV的嚴(yán)重污染可能性后。通過(guò)NTA、western blot,發(fā)現(xiàn)NSCLC 患者外周血中l(wèi)EV的濃度和大小與對(duì)照組相比沒(méi)有變化。
NSCLC 患者血液中腫瘤抗原負(fù)載的 lEV升高情況。(A)流式細(xì)胞術(shù)顯示PD-L1和EMMPRIN腫瘤抗原陽(yáng)性的 lEV數(shù)量變化Z顯著。(B) 從 NSCLC 患者和健康對(duì)照中分離的 lEV 中 EMMPRIN 和 PD-L1 表達(dá)的蛋白質(zhì)印跡結(jié)果。(C)ROC 曲線用于確定單獨(dú)升高的腫瘤抗原lEV或所有六種聯(lián)合抗原的鑒別能力。
進(jìn)一步的流式細(xì)胞術(shù)的結(jié)果表明NSCLC患者血液中PD-L1和EMMPRIN 陽(yáng)性lEV的水平顯著增加,且兩者呈正相關(guān)。而MUC1、ROR1、ROR2、EGFR陽(yáng)性lEV與正常組也有差異性。免疫印跡的結(jié)果進(jìn)一步證實(shí)了這種富集。通過(guò)ROC分析表明,EMMPRIN單獨(dú)預(yù)測(cè)Z佳,AUC為0.75(95%CI:0.66‐0.84)。而所有六個(gè)標(biāo)志物的組合預(yù)測(cè)則更準(zhǔn)確, AUC為0.80(95%CI:0.69-0.90)。該結(jié)果表明lEV相關(guān)腫瘤抗原具有作為NSCLC患者診斷生物標(biāo)志物的潛力。
(a)根據(jù)血液中腫瘤抗原陽(yáng)性PD-L1 lEVs的數(shù)量,繪制了NSCLC患者的Kaplan–Meier生存曲線。(b)初次診斷時(shí)未治療的NSCL患者與 3 個(gè)月(R/NR3)或 6 個(gè)月(R/NR6)CT分期時(shí)血液中 PD-L1陽(yáng)性 lEV 水平對(duì)比,如果患者表現(xiàn)出完全或部分緩解或疾病穩(wěn)定,則將其分層為應(yīng)答者 (R),如果患者表現(xiàn)出疾病進(jìn)展的跡象,則將其分層為無(wú)應(yīng)答者 (NR)。左圖包括所有接受治療的患者,右圖為治療方案中包含免疫治療的患者。
接下來(lái),作者研究了NSCLC患者血漿中PD-L1、EMMPRIN、EGFR、MUC1、ROR1和ROR2 lEVs的增加是否會(huì)影響患者的生存率。結(jié)果發(fā)現(xiàn)血液中只有PD-L1 lEVs含量高的NSCLC患者甚至表現(xiàn)出明顯更好的OS。同時(shí),在進(jìn)行相應(yīng)的化學(xué)免疫治療(CIT,n = 37), 單免疫治療(Mono-ICI,n = 14)或靶向治療(TT,n = 9)之后,與未應(yīng)答組相比,應(yīng)答者的PD-L1 lEVs水平明顯更高,而其他抗原相關(guān)lEVs未見(jiàn)顯著變化。
(e) NSCLC患者根據(jù)其組織PD-L1(tPD-L1)表達(dá)進(jìn)行分組。在治療 3 或 6 個(gè)月后S次分期 CT 中被歸類為 R 或 NR 的患者中,比較單獨(dú)化療 (CIT) 或聯(lián)合單免疫療法 (ICI) 前 PD-L1 lEV 的水平。(g)ROC 分析比較PD-L1 lEV按 tPD-L1 水平分組患者中的預(yù)測(cè)能力。
tPD‐L1在常規(guī)臨床診斷中被用作預(yù)測(cè)免疫治療反應(yīng)的標(biāo)準(zhǔn)。然而,tPD‐L1水平低或缺失(分別<49%或<1%)的晚期NSCLC患者也可以從免疫治療中獲益。而tPD-L1水平和腫瘤比例評(píng)分(TPS)均未與同一患者PD-L1 lEV的水平具有相關(guān)性。而在根據(jù)患者的 tPD-L1 水平對(duì)患者進(jìn)行分組后,在tPD-L1表達(dá)缺失組(<1%)和tPD-L1低表達(dá)的患者(1-49%)中,檢測(cè)到應(yīng)答者的PD-L1 lEV水平明顯高于非應(yīng)答者,相比之下,高tPD-L1(>49%)的患者則沒(méi)有這種差異。ROC的結(jié)果也表明PD-L1 lEV對(duì)于治療效果的預(yù)測(cè)能力在 PD-L1 缺失組 (AUC 0.91;p = 0.01)和低組(AUC 0.90;p = 0.09)極其優(yōu)異,而對(duì) tPD-L1-高患者的預(yù)測(cè)能力相當(dāng)?shù)?(AUC 0.57;p = 0.64)。
總之,該研究結(jié)果將血漿 lEV 上的 PD-L1 確定為一種新的生物標(biāo)志物,可以預(yù)測(cè) tPD-L1 表達(dá)低或缺失的 NSCLC 患者對(duì)免疫治療的反應(yīng)。
實(shí)驗(yàn)方法
細(xì)胞培養(yǎng)與EVs分離
在37°C和5% CO2的條件下,用補(bǔ)充了10%熱滅活(56°C,30分鐘)胎牛血清(FCS)的RPMI-1640培養(yǎng)基培養(yǎng)人源NSCLC細(xì)胞系(ATCC,DSMZ)。為分離EVs,排除支原體污染的細(xì)胞(6xT175培養(yǎng)瓶,貼壁率60-80%)用PBS洗滌兩次,然后在RPMI-1640中培養(yǎng)24小時(shí),該RPMI-1640補(bǔ)充了10%的EV-去除 FCS(在4°C下離心16小時(shí),153,700 g,并通過(guò)0.2μm濾器過(guò)濾,以去除胎牛血清所含EV)。收集上清液在500 g離心5分鐘,然后1,500 g離心15分鐘以去除殘留的細(xì)胞和碎片。然后在17,000 g離心30分鐘收集lEVs沉淀,上清液繼續(xù)在143,000 g離心90分鐘以收集sEVs沉淀。用PBS洗滌EVs一次并用于下游分析。使用差速超速離心法從Z多15毫升的EDTA抗凝血進(jìn)行EV分離。所有EV顆粒在PBS中洗滌一次并儲(chǔ)存在PBS中以進(jìn)行后續(xù)實(shí)驗(yàn)7。
密度梯度離心
EVs與抗原的關(guān)聯(lián)性檢測(cè)是在一個(gè)不連續(xù)的碘克沙醇梯度液上進(jìn)行。簡(jiǎn)而言之,使用在緩沖液緩沖液(0.25 M蔗糖,1 mM EDTA,10 mM Tris-HCl,pH 7.4)稀釋OptiPrep?(Sigma)原液,制備5%、10%、20%和40%的碘克沙醇梯度液。從高濃度到低濃度依次加入梯度液,并在Z上層加入1 mL 存儲(chǔ)在PBS里的細(xì)胞培養(yǎng)源EVs(200 μg)或血漿來(lái)源EVs(300 μg)。在XPN-80超速離心機(jī)(Beckman Coulter)中,采用Sw32.1Ti轉(zhuǎn)子以100,000g、4°C離心18小時(shí)。PBS中洗滌一次后收集了16個(gè)1 mL的組分(fractions),在Max-XP超速離心機(jī)(Beckman Coulter)中使用TLA-55轉(zhuǎn)子以100,000g的速度沉淀后,用PBS洗滌一次。將EVs重懸于Laemmli緩沖液中,進(jìn)行后續(xù)的免疫印跡分析8。
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● 參考文獻(xiàn):
1. Global Cancer Statistics 2020: GLOBOCAN Estimates of Incidence and Mortality Worldwide for 36 Cancers in 185 Countries
2. Pembrolizumab versus Chemotherapy for PD-L1–Positive Non–Small-Cell Lung Cancer
3. PD-L1 Testing for Lung Cancer in 2019: Perspective From the IASLC Pathology Committee
4. Exosomal biomarkers for cancer diagnosis and patient monitoring
5. PD-L1 on large extracellular vesicles is a predictive biomarker for therapy response in tissue PD-L1-low and -negative patients with non-small cell lung cancer.
6. Quantitative Proteomics Identifies Proteins Enriched in Large and Small Extracellular Vesicles
7. EV-TRACK: Transparent reporting and centralizing knowledge in extracellular vesicle research.
8. The impact of disparate isolation methods for extracellular vesicles on downstream RNA profiling
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