【文獻速遞】轉錄因子JUN介導的seRNA形成R環促進鼻咽癌轉移
增強子是DNA遠端元件，在細胞類型特異性生物過程中可激活或增加相關基因的轉錄。轉錄因子 (TF) 通過特殊的識別序列與這些增強子結合，并與輔助因子合作，在增強子和啟動子之間形成染色質環。據報道，超級增強子（SEs）是一系列增強子，也被稱為伸展增強子，存在于對細胞存活和腫瘤發生至關重要的基因附近，通過激活鄰近基因促進致癌過程。增強子（SEs）連接若干啟動子，通常與其目標基因相距數百個干堿基。與典型的增強子（TEs）相比，增強子含有更大的開放染色質結構域，其特征是高水平的H3K27乙酰化（H3K27ac），并富集用于TEs結合。SEs通常與RNA聚合酶II(RNAPII)結合，產生被稱為seRNA的雙向非編碼RNA。seRNAs或類似seRNA的非編碼RNAs的缺失會導致與之相關的蛋自編碼基因下調， seRNAs在腫瘤發生中發揮著重要作用。
鼻咽癌（NPC）是一種起源于異咽部、具有高度轉移潛力的惡性腫瘤。雖然鼻咽癌對放療敏感，但遠處轉移患者的預后仍然很差。1,4-二硝基哌嗪（(DNP）是腌制食品中Z主要的揮發性亞硝胺。一些研究表明，DNP可以在體內促進NPC癌變和轉移。
在本研究中，證明了一種新的鼻咽癌轉移分子機制。采用全局run-on測序、染色質免疫沉淀測序和 RNA測序相結合的方法篩選 seRNA一個與異咽癌轉移相關的特異seRNA (seRNA-NPCM）被鑒定為N-myc下游調控基因1(NDRG1）的轉錄調節因子。已證實主轉錄因子JUN對激活seRNA-NPCM的產生至關重要。從基因間區轉錄的seRNA-NPCM可促進鼻咽癌的體外和體內轉移。在鼻咽癌患者中，seRNA-NPCM 的表達預示病情不佳。SeRNA-NPCM在SE區域形成RNA-DNA環(R-loops），并與 NDRG1和 TRIB1 啟動子上的 hnRNPR結合，從而促進增強子-啟動子環形成和基因轉錄。seRNA-NPCM還與 ACTA1 直接相互作用。這些發現對于闡明 seRNA-NPCM 在鼻咽瘤轉移過程中調節啟動子的分子機制具有重要意義。
論文鏈接：
doi.org/10.1038/s41419-023-05985-9
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