KTA蛋白層析系統(tǒng)延遲體積的確定與設(shè)置
?KTA蛋白層析系統(tǒng)的流路自身包含一定管路體積,這部分管路體積又稱為延遲體積。延遲體積依據(jù)位置不同可以分為梯度延遲體積和收集延遲體積,本文將對以上兩種延遲體積定義、延遲體積確定方法和UNICORN系統(tǒng)中延遲體積的設(shè)置進(jìn)行詳細(xì)介紹。
梯度延遲體積(Gradient delay volume)
梯度延遲體積是指設(shè)置梯度程序時(shí)混合池與層析柱入口之間的體積,這部分管路體積會導(dǎo)致層析柱中真實(shí)梯度與程序中的梯度 (%B curve) 出現(xiàn)一定的延遲(圖1)。梯度延遲體積可以通過理論計(jì)算和實(shí)驗(yàn)測定的方法獲得,在使用特定混合器的層析系統(tǒng)中梯度延遲體積是一個(gè)定值,不會隨著使用層析柱體積大小發(fā)生改變。對于離子交換等通過拉梯度方式進(jìn)行洗脫的層析方法,進(jìn)行梯度優(yōu)化時(shí)尤其要注意,樣品洗脫峰對應(yīng)B%濃度,是此時(shí)混合池正在混合的梯度,并非樣品被洗脫當(dāng)時(shí)進(jìn)入柱子的B%鹽濃度。此時(shí),可以用開始給混合池梯度命令(綠色線起點(diǎn))和電導(dǎo)檢測器檢測到電導(dǎo)值開始增加(藍(lán)色線起點(diǎn))之間的體積差,近似作為梯度延遲體積,用于倒推樣品洗脫時(shí)對應(yīng)的B%濃度。
圖1. 真實(shí)梯度(藍(lán)色)對比程序梯度(綠色)
收集延遲體積(Fraction delay volume)
?KTA系統(tǒng)收集延遲體積指UV檢測器到樣品收集器或者UV檢測器與outlet之間管路的體積(圖2)。
圖2. 蛋白層析系統(tǒng)?KTA系統(tǒng)延遲示意圖
?KTA蛋白層析系統(tǒng)收集樣品時(shí),需要在系統(tǒng)中準(zhǔn)確設(shè)置收集延遲體積,從而避免因?yàn)槭占舆t體積錯(cuò)誤,造成?KTA紫外峰圖顯示的樣品出峰位置與對應(yīng)的收集管發(fā)生錯(cuò)位的現(xiàn)象(圖3)。圖3中(a)圖沒有收集設(shè)置延遲體積導(dǎo)致SDS-PAGE膠圖與UV峰圖相比出現(xiàn)滯后現(xiàn)象;而(b)圖中準(zhǔn)確設(shè)置收集延遲體積,SDS-PAGE膠圖與UV峰圖可以較好的進(jìn)行對應(yīng)[1]。
圖3. 系統(tǒng)延遲體積設(shè)置對收集位置的影響[1]
收集延遲體積確定方法
系統(tǒng)延遲體積可以通過理論計(jì)算和實(shí)驗(yàn)測定的方法進(jìn)行確定,以下將對兩種延遲體積確定方法分別進(jìn)行介紹。
收集延遲體積理論計(jì)算方法
理論計(jì)算是獲得延遲體積較簡便方便的方法,延遲體積理論計(jì)算包括以下3個(gè)步驟:
1
確定設(shè)備系統(tǒng)流路中所有成分部件。
2
查表確定系統(tǒng)流路中各個(gè)硬件單元(?KTA pure User Manual 9.14章節(jié))和單位長度管路對應(yīng)體積(表1)。
3
計(jì)算系統(tǒng)延遲體積:將混合池體積與連接層析柱管路體積相加即獲得梯度延遲體積;將UV檢測器樣品流通池的1/2體積(UV檢測器檢測點(diǎn)為流通池中心區(qū)域)與流路中其它硬件與管路的體積進(jìn)行加和,得到收集延遲體積。
表1. ?KTA系統(tǒng)不同內(nèi)徑管路應(yīng)用及單位長度管路內(nèi)部體積
收集延遲體積的實(shí)驗(yàn)測定方法
UV吸收值測定法
連接F9-R和F9-T收集器的?KTA pure系統(tǒng)(圖3)可以通過UV吸收值測定的方法得到,通過測定V1(樣品入口與UV檢測器之間體積)、V2(樣品入口到收集器樣品出口端之間的體積),計(jì)算V2-V1+1/2V(V為UV檢測器流通池體積)獲得延遲體積[2][3]。具體實(shí)驗(yàn)步驟如下:
1
設(shè)置系統(tǒng)流速1 ml/min(如果流速不準(zhǔn)確,檢查系統(tǒng)泵是否進(jìn)氣,繼續(xù)實(shí)驗(yàn)前確定流速的準(zhǔn)確性)。
2
使用1%-5%丙酮溶液充滿樣品環(huán)(例:樣品體積100 μl)。
3
設(shè)置UV檢測器到收集器之間所有部件為bypass模式。
4
用水充滿系統(tǒng)管路,設(shè)置流速1 ml/min,用樣品環(huán)中丙酮溶液為樣品上樣。
5
計(jì)算從樣品注入點(diǎn)開始到層析圖譜紫外吸收Z高點(diǎn)流路體積,即為V1。
6
重新配置系統(tǒng)流路,將收集器置于UV檢測器之前。斷開UV檢測器兩端管路,用死體積較小的連接頭將兩端管路連接起來。收集器出口管路連入U(xiǎn)V檢測器,UV檢測器出口端接入廢液口Waste。
7
設(shè)置一個(gè)較大的收集體積(比如100 ml),保證實(shí)驗(yàn)過程中樣品從收集口流出。
8
設(shè)置流速1 ml/min,加入樣品丙酮溶液。
9
計(jì)算從樣品注入點(diǎn)開始到層析圖譜紫外吸收Z高點(diǎn)流路體積,即為V2。
10
依據(jù)公式計(jì)算V2-V1+1/2V(V為UV檢測器流通池體積),獲得延遲體積。
圖4. (A) ?KTA pure蛋白層析系統(tǒng)(B)F9-R收集器(C)F9-T收集器
稱重法
通過稱量水的重量測定收集延遲體積(容器重量需要預(yù)先稱重)[3]。
1
設(shè)置系統(tǒng)流路從UV流通池直接流向收集器。
2
用魯爾接頭替換UV檢測器入口接管。
3
用注射器將UV流通池到收集器尖端整個(gè)管路用水充滿。
4
使用注射器用空氣將UV流通池到收集器尖端整個(gè)管路中的水完全替換出來。
5
通過稱量水的重量測定收集延遲體積。
6
重復(fù)3次實(shí)驗(yàn)取平均值。
標(biāo)準(zhǔn)配置的?KTA pure收集延遲體積
標(biāo)準(zhǔn)配置、使用標(biāo)準(zhǔn)長度管路的?KTA pure設(shè)備,其設(shè)備標(biāo)準(zhǔn)延遲體積數(shù)據(jù)已在?KTA pure使用手冊中列出。手冊中延遲體積數(shù)據(jù)是依據(jù)U9-M紫外檢測器計(jì)算,如果使用U9-L紫外檢測器需要在此體積基礎(chǔ)上加9μl (2mm流通池)、4μl(5mm流通池)。
標(biāo)準(zhǔn)配置?KTA pure Micro/Micro kit配置微量紫外檢測器、微量電導(dǎo)檢測器和微量出口閥。
標(biāo)準(zhǔn)配置的?KTA pure系統(tǒng)可以通過查詢對應(yīng)表格(表2、表3和表4)得到標(biāo)準(zhǔn)配置設(shè)備收集延遲體積信息。
其他型號標(biāo)準(zhǔn)配置的?KTA蛋白層析系統(tǒng)也可以通過查詢使用手冊獲得設(shè)備標(biāo)準(zhǔn)收集延遲體積。
表2. ?KTA pure25收集延遲體積
表3. ?KTA pure Micro/Micro kit收集延遲體積
表4. ?KTA pure 150收集延遲體積
UNICORN系統(tǒng)中收集延遲體積的設(shè)置
UNICORN系統(tǒng)中可以設(shè)置UV檢測器到Outlet閥及UV檢測器到收集器之間的延遲體積(圖4),具體設(shè)置步驟如下:
1
在System Control界面選擇System-Settings,打開System Settings對話框。
2
點(diǎn)擊 Fraction collection →Delay volumes。
3
在Detector-Frac 中輸入U(xiǎn)V檢測器到收集器之間的延遲體積數(shù)值;在 Detector – Outlet中輸入U(xiǎn)V檢測器到出口閥之間的延遲體積數(shù)值。
圖4. UNICORN系統(tǒng)延遲體積的設(shè)置界面
需要說明的是不同型號的?KTA蛋白層析系統(tǒng)延遲體積的確定和設(shè)置方法,操作細(xì)節(jié)上可能存在細(xì)微差別,具體設(shè)置方法可以查看對應(yīng)型號產(chǎn)品的使用手冊。
參考文獻(xiàn):
1. 蘆亞菲. 《蛋白質(zhì)制備與鑒定平臺蛋白層析系統(tǒng)介紹》清華大學(xué)蛋白質(zhì)研究技術(shù)中心蛋白質(zhì)制備與鑒定平臺 2020/05/16 https://phoenix.tsinghua.edu.cn/index.php?c=show&id=519
2. ?KTA pure User Manual 29119969 AE
3. ?KTA Laboratory-scale Chromatography Systems CY13989-02Dec20-HB. Appendix 3 Determination of delay volumes
聲明:本文為作者原創(chuàng)S發(fā),嚴(yán)禁私自轉(zhuǎn)發(fā)或抄襲,如需轉(zhuǎn)載請聯(lián)系并注明轉(zhuǎn)載來源,否則將追究法律責(zé)任
點(diǎn)亮
與
,傳遞信息 ↓ ↓
全部評論(0條)
推薦閱讀
-
- KTA蛋白層析系統(tǒng)延遲體積的確定與設(shè)置
- ?KTA蛋白層析系統(tǒng)延遲體積的確定與設(shè)置
-
- 玩轉(zhuǎn)KTA | 用好紫外監(jiān)測器,保護(hù)層析系統(tǒng)的“眼睛”
- 文末掃描二維碼,獲取?KTA 系統(tǒng)維護(hù)指南
-
- KTA process層析系統(tǒng)有哪些符合清潔驗(yàn)證要求的設(shè)計(jì)?
- 文末了解以舊換新活動(dòng)!
-
- 一次性層析系統(tǒng)KTA ready 450,讓AAV純化更passion!
- 文末掃碼,獲取更多產(chǎn)品資料與技術(shù)文獻(xiàn)
-
- KTA層析實(shí)驗(yàn)精準(zhǔn)上樣:如何“搞定”系統(tǒng)內(nèi)部體積?
- 文末直達(dá)Cytiva官網(wǎng)在線計(jì)算工具!
-
- 玩轉(zhuǎn)KTA|解鎖新可能:KTA與不同檢測器聯(lián)用
- 為生物分子純化與分析開辟更多可能性!
-
- 玩轉(zhuǎn)KTA|關(guān)于KTA溶劑耐受,你一定要知道的…
- 這些溶劑可以在?KTA上用嗎?
-
- 【明日開講】KTA系統(tǒng)與不同檢測器聯(lián)用的選擇與應(yīng)用
- 【明日開講】?KTA系統(tǒng)與不同檢測器聯(lián)用的選擇與應(yīng)用
-
- 導(dǎo)電與防靜電體積電阻率測試儀
- Huace300 型表面、體積電阻率測定儀采用高精度、 低溫漂系數(shù)極低的電阻,本儀器既可測量高電阻,又可測微電流。采用了新型集成電路以及我單位的專利技術(shù)。測量精度達(dá)到3‰。
-
- 玩轉(zhuǎn)KTA|Sample Loop與Superloop的使用及維護(hù)
- 關(guān)注Cytiva學(xué)堂,了解更多實(shí)驗(yàn)技巧
-
- 玩轉(zhuǎn)KTA|KTA可以在線配置了!一鍵操作,告別“內(nèi)耗”
- Configure ?KTA systems,你的專屬?KTA層析設(shè)備配置助手
①本文由儀器網(wǎng)入駐的作者或注冊的會員撰寫并發(fā)布,觀點(diǎn)僅代表作者本人,不代表儀器網(wǎng)立場。若內(nèi)容侵犯到您的合法權(quán)益,請及時(shí)告訴,我們立即通知作者,并馬上刪除。
②凡本網(wǎng)注明"來源:儀器網(wǎng)"的所有作品,版權(quán)均屬于儀器網(wǎng),轉(zhuǎn)載時(shí)須經(jīng)本網(wǎng)同意,并請注明儀器網(wǎng)(www.189-cn.com)。
③本網(wǎng)轉(zhuǎn)載并注明來源的作品,目的在于傳遞更多信息,并不代表本網(wǎng)贊同其觀點(diǎn)或證實(shí)其內(nèi)容的真實(shí)性,不承擔(dān)此類作品侵權(quán)行為的直接責(zé)任及連帶責(zé)任。其他媒體、網(wǎng)站或個(gè)人從本網(wǎng)轉(zhuǎn)載時(shí),必須保留本網(wǎng)注明的作品來源,并自負(fù)版權(quán)等法律責(zé)任。
④若本站內(nèi)容侵犯到您的合法權(quán)益,請及時(shí)告訴,我們馬上修改或刪除。郵箱:hezou_yiqi
最新話題
最新文章
- 變壓器高頻電流局放傳感器-高靈敏度
- 石油開采環(huán)網(wǎng)柜局放監(jiān)測方案-實(shí)時(shí)監(jiān)測
- 電力戶外局放監(jiān)測傳感器-高靈敏度
- 低壓供電電纜局放監(jiān)測系統(tǒng)-高靈敏度
- 工業(yè)園區(qū)開關(guān)柜局放傳感器-實(shí)時(shí)監(jiān)測
- 商業(yè)供配電站智慧系統(tǒng)方案-自動(dòng)分析
- 錨索測力計(jì)取基準(zhǔn)值時(shí)溫度波動(dòng)如何應(yīng)對?
- 農(nóng)田小氣候觀測系統(tǒng)—提前預(yù)警極端天氣和病蟲害,幫助農(nóng)戶采取防御措施,減少損失
- 酵母單雜交原理
- 田小氣候觀測站—為農(nóng)業(yè)生產(chǎn)決策、資源優(yōu)化配置及災(zāi)害預(yù)警提供科學(xué)依據(jù)
作者榜
參與評論
登錄后參與評論