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2025-05-16 03:30:35多肽文庫構建
多肽文庫構建是一種合成大量具有序列多樣性的多肽集合的技術。它通過在固定位置上引入不同的氨基酸殘基,生成一系列具有不同序列的多肽。這些多肽可以用于藥物篩選、疫苗開發、疾病診斷等領域。通過高通量合成與篩選,可以快速鑒定出具有特定生物活性的多肽分子,加速新藥研發進程。多肽文庫構建技術具有高度的靈活性和可定制性,能夠滿足不同研究需求,是現代生物醫學研究中的重要工具。

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2023-06-16 14:28:25構建表達載體想降本增效?看這一篇就夠了
想要開發有穩定生產能力的細胞株,除了在細胞開發中對于細胞表達能力的評估篩選以外,前期的表達載體的構建過程也非常重要。使用納升移液技術可以顯著提高細胞株過程基因合成,表達載體構建以及轉染篩選等實驗的實驗效率,降低實驗成本。聲波移液展示Echo?移液系統依靠專 利技術(U.S. Patent 6938995)和創新方法改變移液操作在整個生命科學領域中的應用。它采用動態液體分析(Dynamic Fluid Analysis?, DFA)技術和聲波移液(Acoustic Droplet Ejection,ADE)技術,讓研究人員能夠移取多種不同類型的液體,完成微量小體積(2.5/25nL)的移液工作。全流程無需槍頭耗材,無交叉風險。納升移液技術讓細胞株構建更快、更準、更經濟更快—— Echo快速任意孔到任意孔移液,極速基因組裝在質粒構建前期,需要非常多的準備實驗,如基因組裝中將不同的DNA片段混合,在檢測反應中將不同的樣本組合,在NGS文庫構建過程中將多個文庫pooling到一起,在CRISPr基因編輯中構建sgRNA文庫等等,這些實驗都需要進行快速、靈活的加樣移液,就算使用高通量的移液工作站,往往也要好幾小時才能完成。納升移液技術Echo的任意孔到任意孔的快速移液特點則讓此類應用簡單、快速化,每次轉移花費更少時間更短。這為基因組裝節省了高達82%的時間。從母板任意孔轉移任意體積樣品到目標板任意孔中,實現快速挑選、樣品混合和組合。有效縮短實驗周期更準—— Echo加樣精 準,提高克隆效率利用質粒上含有的抗性選擇進行篩選,需要對篩選結果進行鑒定, 而qPCR也是常用的鑒定方法之一。使用Echo納升移液技術進行微量化克隆篩選鑒定,可以以更少的實際成本精 準完成實驗。使用Echo完成 qPCR的反應體系構建,通過減少每個組件的體積,并使用不使用tips的Echo,將反應體積縮小10倍,從10 μL減少到1 μL,成本降低了8倍。精 準減小實驗體積更經濟—— Echo微量化,縮小反應體系,讓新技術更經濟系統化的設計必然會帶來更大的樣本量,從而導致更高的費用, Echo采用聲波的能量進行無接觸式移液,且每滴液滴僅為2.5nL或25nL,因此可以直接省去吸頭耗材的消耗,也可以將檢測反應體系降低4-100倍,使成本急劇下降。有效縮減試劑成本Gibson and Golden Gate Assembly實驗:不同反應體積的成本效益和組裝效率比較產品信息“僅用于科研,不用于臨床診斷”
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2023-01-10 12:42:52貝克曼庫爾特Biomek NGeniuS與IDT文庫制備自動化解決方案
隨著基因組測序和數據分析方法的廣泛普及,越來越多的實驗室正在探索下一代測序(Next-Generation Sequencing,NGS)作為研究工具的可行性。然而,NGS文庫的手動制備過程單調乏味,根據所構建文庫的類型而異,耗時從數小時到數天時間不等,并且操作過程中必須小心謹慎,以避免人工出錯導致的制備失敗,浪費寶貴樣本。Biomek NGeniuS系統是一款全自動文庫制備系統,幫助我們從第 一步即確保正確無誤。DNA樣品上機,撥動轉盤,按下按鈕,運行過程無需值守,每批次可支持運行4-24任意數量的樣品,是實驗室追求靈活性和自動化的理想之選。圖1 Biomek NGeniuS全自動文庫制備系統IDT xGen cfDNA & FFPE DNA Library Prep Kit 便是一款支持自動化的試劑盒。該試劑盒提供高一致性的文庫制備方法,獨特的兩步連接法能夠有效抑 制接頭二聚體和模板DNA自連,因而可有效提高文庫轉換率,尤其適用于cfDNA和FFPE等低質量樣品,有助于研究人員發現和表征腫瘤樣品中出現的低頻變異位點。圖2 IDT xGen cfDNA & FFPE DNA Library Prep Kit工作流程我們使用Biomek NGeniuS系統對三種不同類型的樣品,cfDNA、FFPE和gDNA,分別構建24個、10個和4個文庫。cfDNA 樣品所得文庫平均濃度為16.67ng/μL。cfDNA樣品連接后擴增片段平均長度為362bp,長度分布一致且呈正態。與參考基因組相比,該樣品組從NGeniuS實驗中獲得的所有文庫比對率為99.49%,配對的reads比對到參考基因組的比對率為99.84%。23份樣品中reads平均重復率為0.46%。圖3  以cfDNA為起始樣品,在Biomek NGeniuS 系統上使用IDT xGen cfDNA & FFPE DNA Library Prep Kit所制備文庫的分析結果。FFPE樣品構建的文庫平均片段長度為378 bp,長度呈正態分布。與參考基因組相比,該樣品組從NGeniuS實驗中獲得的所有文庫比對率為99.8%,配對的reads比對到參考基因組的比對率為99.84%。10份樣品中reads平均重復率為0.37%。圖4  以FFPE DNA為起始樣品,在Biomek NGeniuS 系統上使用IDT xGen cfDNA & FFPE DNA Library Prep Kit所制備文庫的分析結果。gDNA樣品制備的文庫平均片段長度為391bp,長度分布與 IDT xGen cfDNA & FFPE DNA Library Prep Kit 的預期一致。與參考基因組相比,該樣品組從 NGeniuS實驗中獲得的所有文庫的比對率為99.2%,配對的reads比對到參考基因組的比對率為99.3%。3份樣品中reads平均重復率為0.56%。圖5  以gDNA為起始樣品,在Biomek NGeniuS 系統上使用IDT xGen cfDNA & FFPE DNA Library Prep Kit所制備文庫的分析結果。在Biomek NGeniuS全自動文庫制備系統上使用IDT xGen cfDNA & FFPE DNA Library Prep kit構建文庫,所得文庫片段大小分布一致,并符合IDT xGen cfDNA & FFPE DNA Library Prep Kit說明書建議的文庫大小范圍。對三種不同濃度的樣品重復進行測序,結果表明,平均文庫大小為362~391bp。所獲文庫比對率>99.2%,配對的reads比對到參考基因組的比對率>99.3%,重復率
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2022-11-21 10:19:06“沃”的實驗 | 13份動物模型構建方法系列資料上新,造模不再難!
在做基礎研究時加入動物實驗不僅會使研究工作更完善,也會提高投稿的命中率,但是想把實驗做成功卻不是件容易的事兒,因為在動物造模中總遇到各種難題:搞不清動物建模標準化的流程,做起實驗磕磕絆絆造模需要注意的細節多,反復摸索十幾遍才造模成功明明按照文獻中的實驗方法造模,卻還老是不成功“沃”的實驗全網最全的生命科學研究線上學習平臺第二期內容:常見疾病動物模型——構建方法系列2幫助大家解決造模中遇到的難題第二期內容有什么?“沃”的實驗——全網最全的生命科學研究線上學習平臺第二期內容,為大家分享常見疾病動物模型構建方法,涵蓋8大視頻課程+2大實驗手冊+3大建模的標準操作流程。5位老師線上為你講解不同動物模型的背景、造模方法等內容,理論結合實踐,希望能給大家的動物建模帶來更多新思路和新靈感。點擊鏈接,即可進入學習  8大視頻課程  2大實驗手冊  3大建模的標準操作流程歡迎大家收藏「“沃”的實驗」線上學習平臺學習平臺,內容將持續更新下期內容預告: 實驗動物手術操作-手術方法 
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2022-05-06 09:04:16多肽芯片能用在哪里?
多肽芯片能用在哪里?多肽芯片是一種新型的生物芯片,是研究蛋白質與蛋白質或其他物質(如核酸、多糖、化合物)之間相互作用最直觀的研究技術。多肽芯片在諸多領域中具有廣泛的應用前景,如疫苗開發、藥物研發和篩選、臨床檢測以及蛋白質的基礎功能研究。 多肽芯片可用在抗原表位篩選、藥物開發及篩選、臨床檢測等。l  多肽芯片在抗原表位篩選方面體現出巨大的優勢,可大量縮短開發時間,為前期的抗體篩選提供準確的指標和快速的反饋;l  多肽芯片為藥物開發及篩選提供有效的解決平臺,可有效提高新藥研發的成功功率,降低研發失敗的可能性,加快藥物研發進程;l  現代醫療技術顯示,大多數疾病與蛋白質表達異常有關,通過檢測患者樣本中的蛋白活性即可找到其發病機理,多肽芯片技為該難題提供了快捷的方法,使得對癥下藥成為可能。 Aurora提供多肽芯片的制備用到的微陣列點樣設備——多肽芯片點樣儀Aurora多肽芯片點樣儀采用化學固相合成法,可按需制備穩定的多肽微陣列芯片,如新冠病毒原始毒株及其突變體奧密克戎S蛋白、N蛋白的微陣列芯片,更多產品詳情可進一步了解產品價格或技術參數等信息,直接聯系Aurora員。【內容源自Aurorabiomed公眾號《多肽芯片為什么那么火?》,轉載請注明】Aurora集團30年來致力于制造生物醫藥領域自動化高通量設備。
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2022-04-29 09:33:56什么是多肽芯片技術?
什么是多肽芯片?多肽芯片是一種新型的生物芯片,是研究蛋白質與蛋白質或其他物質(如核酸、多糖、化合物)之間相互作用最直觀的研究技術。多肽芯片在諸多領域中具有廣泛的應用前景,如疫苗開發、藥物研發和篩選、臨床檢測以及蛋白質的基礎功能研究。 多肽芯片如何制備多肽芯片是將已知的蛋白序列或任意設計的氨基酸序列分解成包含重疊氨基酸的多肽片段,將這些多肽片段按一定次序固定在經特殊處理過的載體基質上,每張芯片包含成千上萬甚至更多的肽鏈。將待測物與芯片反應,經過免疫檢測技術發現與待測物有結合反應的位點/域,經過圖像數據處理與分析,尋找蛋白質/氨基酸與待測物的結合部位。 多肽芯片技術及儀器l  多肽芯片技術可高通量點樣,多肽芯片上承載大量的多肽片段,可快速高效的找到相應結合位點/域;l  點樣技術穩定可靠,多肽芯片上固載的多肽片段包含蛋白全序列,相對于原大分子蛋白質而言更穩定,不易分解失活,采集的數據更為準確;l  點樣靈活多樣,多肽片段可不局限于已知的蛋白結構,構成多肽分子的氨基酸可以是進行過化學修飾的非天然氨基酸,在藥物研發和篩選方面具有很強的靈活性;l  Aurora多肽芯片點樣儀:Aurora集團30年來致力于制造生物醫藥領域自動化高通量設備。Aurora多肽芯片點樣儀采用化學固相合成法,可按需制備穩定的多肽微陣列芯片,如新冠病毒原始毒株及其突變體奧密克戎S蛋白、N蛋白的微陣列芯片,更多產品詳情可進一步了解產品價格或技術參數等信息【內容源自Aurorabiomed公眾號《多肽芯片為什么那么火?》,轉載請注明】
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