產品簡介
Plant Tissue Direct PCR Kit (With Dye)植物組織直接PCR試劑盒是一款可直接對不同類型植物葉片進行PCR擴增的試劑盒,適應性廣、穩定性強。試劑盒采用獨特的裂解緩沖液體系,可以快速的裂解多種植物樣品并釋放出基因組DNA,不需要除去蛋白、RNA或次生代謝產物等,即可將釋放出的基因組DNA作為模板直接用于PCR反應。此外,樣品使用量少,低至1 mm植物葉片即可進行實驗。
本試劑盒中提供的2× Plant Master Mix具有很強的擴增兼容性,能直接以待測樣品裂解液為模板,進行高效特異性擴增。該試劑為2倍濃縮PCR反應混合液,包含了用于PCR擴增除模板和引物外的所有組分,大大簡化操作過程,降低污染幾率。
該試劑盒可用于轉基因植株鑒定、植物基因分型等。
組分信息
類別 |
組分編號 |
組分名稱 |
10187ES05 |
10187ES50 |
10187ES70 |
Part I |
10187-A |
Buffer P1 |
250 μL |
1.25 mL × 2 |
5 mL × 2 |
10187-B |
Buffer P2 |
50 μL |
500 μL |
1 mL × 2 |
|
Part II |
10187-C |
2 × Plant Master Mix* |
50 μL |
500 μL |
1 mL × 2 |
*2× Plant Master Mix:包含熱啟動Taq DNA聚合酶、dNTP混合物、MgCl2、反應緩沖液、PCR反應增強劑、優化劑以及穩定劑等,同時包含電泳Loading Buffer,PCR完成之后可直接電泳。
儲存條件
1. 試劑10187-A【Buffer P1】,置于2-8℃保存。有效期1年。
2. 試劑10187-B【Buffer P2】,中和裂解產物,利于更長時間保存樣本,置于2-8℃保存。有效期1年。
3. 試劑10187-C【2 × Plant Master Mix】,-25~-15℃保存,避免反復凍融。有效期1年。
使用說明
a. 研磨儀破碎:將直徑5 mm左右的葉片置于50 μL Buffer P1中,用研磨儀加鋼珠(鋼珠直徑3mm左右,共2個)破碎葉片(45 Hz,1 min),葉片破碎后溶液呈現綠色,瞬時離心,上清液請放在4℃備用,取1 μL用于PCR擴增。
b. 槍頭搗碎:推薦使用幼嫩葉片。將直徑5 mm左右的葉片置于50 μL Buffer P1中,用槍頭將葉片搗碎,搗碎后溶液呈現綠色,瞬時離心,上清液請放在4℃備用,取1 μL用于PCR擴增。
組分 |
體積(μL) |
體積(μL) |
終濃度 |
2× Plant Master Mix |
10 |
25 |
1× |
Forward Primer (10 μM) |
0.5 |
1 |
0.2-0.25 μM |
Reverse Primer (10 μM) |
0.5 |
1 |
0.2-0.25 μM |
裂解產物(DNA模板) |
1 |
2 |
- |
ddH2O |
To 20 |
To 50 |
- |
表1 反應體系
【注】:各組分使用前應充分混勻。
循環步驟 |
溫度 (°C) |
時間 |
循環數 |
預變性 |
94 |
5 min |
1 |
變性 |
94 |
10 sec |
35 |
退火 |
50-65 |
20 sec |
|
延伸 |
72 |
1 min/kb |
|
終延伸 |
72 |
5 min |
1 |
表2 反應條件 |
【注】:
注意事項
常見問題與解決方法
常見問題 |
可能原因 |
解決方法 |
陽性對照、待測樣本均無條帶 |
PCR反應體系或反應條件不合適。 |
使用梯度PCR摸索PCR最佳反應條件。 |
PCR試劑保存不當失去活性。 |
2× PCR Mix應保存于-20℃,使用時避免反復凍融。若使用頻繁,可在4℃短時間存放。 |
|
引物設計問題。 |
嘗試重新設計引物進行檢查。 |
|
陽性對照有目的條帶,待測樣本無條帶或條帶弱 |
裂解液、中和液加入比例不當,裂解混合液影響PCR體系的pH值。 |
正常條件下,中和后的裂解混合液的pH應該在7-8左右(裂解產物和Buffer P2嚴格按照5:1的量進行中和)。 |
樣本裂解混合液保存不當或保存時間過久,DNA基因組已經降解。 |
裂解混合液液可在4℃保存5天,盡量使用新制備的裂解液混合液進行PCR。 |
|
模板加入量不適合。 |
在反應體系<5%范圍內優化模板加入量。 |
|
PCR循環數不足。 |
適當增加PCR的循環數,推薦35-40循環為佳。因模板復雜,一般PCR反應要比用純化的DNA模板多5-10個循環為佳。 |
|
非特異性擴增 |
PCR退火溫度太低,循環數、引物濃度或模板濃度太高。 |
增加PCR退火溫度,降低PCR循環數、引物濃度或模板濃度。 |
PCR引物錯配。 |
重新設計PCR引物。 |
|
配制PCR反應體系時溫度太高或配制完成后放置時間太久。 |
PCR反應體系的配制在低溫下進行,配制完成后盡快進行PCR擴增反應。 |
|
陰性對照出現目的條帶 |
操作工具或試劑污染。 |
實驗所有試劑或器材均應高壓滅菌。操作時應小心輕柔,防止將靶序列吸入加樣槍內或濺出離心管外。 |
樣本間交叉污染。 |
每個取樣器只對一個樣本使用;或取完一個樣本后,將取樣器刃口浸入2%的次氯酸鈉溶液中,反復涮洗,然后用干凈的紙巾擦干殘液。 |
Ver. CN20231102
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