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貨號:633701
產品簡述
——為推動單細胞研究的進展,測序巨頭相繼推出新一代測序儀,其中BD RhapsodyTM單細胞分析系統便是其中的佼佼者,此系統的誕生基于BD在細胞生物學領域40年的專業技術,克服了傳統檢測的局限性,能夠對成全上萬個單細胞的數百個表達基因同時進行數字定量,每個細胞提取獨立數據,體現異質性,可以鑒定和表征新型和罕見細胞類型,有助于理解從免疫學到腫瘤學等多個領域內的生物學過程。
BD RhapsodyTM單細胞分析工作流程
BD Rhapsody核心技術
——BD Rhapsody利用微孔進行單細胞分離,屬于Micriwell-seq。20萬個微孔的尺寸被設計成一個微孔恰好可以容納一個bead(磁珠),bead上連接逆轉錄引物,引物主要包括以下幾個部分:
CL(cell label,細胞標簽),一個磁珠上的引物CL序列相同,不同磁珠上的引物CL序列不同,從而達到區分序列的作用
UMI(unique molecular identifier),一個磁珠上的引物UMI各不同,可以區分最初的mRNA分子,以便后期分析時消除擴增帶來的偏差
poly dT,和mRNA 3'端poly A互補配對。同時懸液被稀釋到適當濃度,微孔隨機捕獲單細胞,單細胞捕獲率為80%,捕獲1K個細胞出現的多細胞比率約為0.2%,捕獲10K個細胞多細胞比率約為2.4%。Rhapsody建議檢測通量為100-10000。
一個微孔=一個單細胞=一個磁珠=一個RNA-Seq
BD Rhapsody技術優勢
靶向基因檢測,避免看家基因占用大量測序數據,節省測序和分析成本
靶向定制panel,選定特定基因組合,提高UMI計數效率,罕見轉錄本檢測閾值更低
引入單細胞測序金標準,BD分子標簽,降低非特異性表達
完整cDNA可在磁珠微球結構保存長達16周,隨用隨取
單次實驗AbSeq kit通過獨特的抗體標記方法,既可以提高樣品通量(最多12個樣本同時建庫,可等分,可隨機組合),又可同時進行單細胞蛋白和轉錄組聯合檢測,降低成本的同時,也為單細胞多組學研究提供了更高 效的平臺
可分辨更精細、微觀的細胞群和細胞亞種群
捕獲效率高達97%,遠高于市場上目前所有大通量單細胞轉錄組測序技術
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GNTTM片段篩選磁珠,即: DNA Selection MagBeads基于SPRI (Solid Phase Reverse Immobilization)原理,適用于高通量測序文庫構建中的DNA純化與片段大小分選,可以實現良好的分選效果。是吉恩特生物自主研發生產的片段篩選磁珠,可兼容各類品牌的DNA、RNA 建庫試劑盒,與目前廣泛使用的 AMPure XP Beads 使用方式相同,文庫產量、大小分布高度一致,實現較好的替代效果。
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高通量測序技術(High-throughput sequencing, HTS)又稱下一代測序技術(Next-generation sequencing, NGS),是對傳統Sanger測序(稱為一代測序技術)革命性的改變, 一次對幾十萬到幾百萬條核酸分子進行序列測定的技術。 在提供豐富的遺傳學信息的同時,還可大大降低測序費用、縮短測序時間。
Sciclone? G3 NGSx iQ?高通量自動化建庫工作站通過整合協同工作, 自動化程度獲得極大提高: 一個Twister III五維機器人手臂、可存放27盒槍頭的儲板棧、高通量精準移液的 Sciclone G3 NGSx文庫制備工作站、內嵌桌面式Inheco ODTC熱循環儀、直觀圖示化的用戶界面、經PerkinElmer專業開發驗證、兼容不同品牌供應商建庫試劑盒的NGS自動化建庫程序。