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蛋白質質譜分析

au8800a 2013-04-09 01:20:19 321  瀏覽
  • 請問打質譜能否做到類似于edman測序那樣測出蛋白的一個個氨基酸序列(就是一級結構)?蛋白質譜鑒定到底是鑒定什么?如果不能做到測一級結構,那么質譜也只能鑒定已知蛋白咯?而不能涉... 請問打質譜能否做到類似于edman測序那樣測出蛋白的一個個氨基酸序列(就是一級結構)?蛋白質譜鑒定到底是鑒定什么? 如果不能做到測一級結構,那么質譜也只能鑒定已知蛋白咯?而不能涉及未知蛋白? 展開

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全部評論(1條)

  • Eshine02 2013-04-10 00:00:00
    你說的很對,質譜分析只是檢測蛋白消化后的所有肽段的質量,然后跟已知的蛋白指紋進行比較,確定可能的蛋白種類。因此,質譜能檢測出是未知蛋白,但是無法確定具體的氨基酸序列。

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蛋白質質譜分析
請問打質譜能否做到類似于edman測序那樣測出蛋白的一個個氨基酸序列(就是一級結構)?蛋白質譜鑒定到底是鑒定什么?如果不能做到測一級結構,那么質譜也只能鑒定已知蛋白咯?而不能涉... 請問打質譜能否做到類似于edman測序那樣測出蛋白的一個個氨基酸序列(就是一級結構)?蛋白質譜鑒定到底是鑒定什么? 如果不能做到測一級結構,那么質譜也只能鑒定已知蛋白咯?而不能涉及未知蛋白? 展開
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原文地址:http://www.easylabplus.com/index-news-describe-html-938.html

一張化合物的質譜包含著有關化合物的豐富信息,大多數情況下,僅依靠質譜就可以確定化合物的分子量、分子式和分子結構。而且,質譜分析的樣品用量極微,因此,質譜法是進行有機物鑒定的有力工具。接下來咱們就利用具體的例子來解析質譜圖。

當然,對于復雜的有機化合物的定性,還要借助于紅外光譜、紫外光譜、核磁共振等分析方法。


質譜的解析是一種非常困難的事情。自從有了計算機聯機檢索之后,特別是數據庫越來越大的今天,盡管靠人工解析El質譜已經越來越少,但是,為了加深對化合物分子斷裂規律的了解,作為計算機檢索結果的檢驗和補充手段,質譜圖的人工解析還有它的作用,特別是對于譜庫中不存在的化合物質譜的解析。另外,在MS/MS分析中,對子離子譜的解析,目前還沒有現成的數據庫,主要靠人工解析。因此,學習一些質譜解析方面的知識,在目前仍然是有必要的。



El質譜的解析

一、分子量的確定


分子離子的質荷比就是化合物的分子量。因此,在解析質譜時首先要確定分子離子峰,通常判斷分子離子峰的方法如下:

1.分子離子峰一定是質譜中質量數Z大的峰,它應處在質譜的Z右端。


2.分子離子峰應具有合理的質量丟失。也即在比分子離子小4~14及20~25個質量單位處,不應有離子峰出現。否則,所判斷的質量數Z大的峰就不是分子離子峰。因為一個有機化合物分子不可能失去4~14個氫而不斷鏈。如果斷鏈,失去的Z小碎片應為CH3,它的質量是15個質量單位。同樣,也不可能失去20~25個質量單位。


3.分子離子應為奇電子離子,它的質量數應符合氮規則。所謂氮規則是指在有機化合物分子中含有奇數個氮時,其分子量應為奇數。含有偶數個(包括0個)氮時,其分子量應為偶數。這是因為組成有機化合物的元素中,具有奇數價的原子具有奇數質量,具有偶數價的原子具有偶數質量,因此,形成分子之后,分子量一定是偶數。而氮則例外,氮有奇數價而具有偶數質量,因此,分子中含有奇數個氮,其分子量是奇數,含有偶數個氮,其分子量一定是偶數。


如果某離子峰完全符合上述三項判斷原則,那么這個離子峰可能是分子離子峰;如果三項原則中有一項不符合,這個離子峰就肯定不是分子離子峰。應該特別注意的是,有些化合物容易出現M-1峰或M+1峰,另外,在分子離子很弱時,容易和噪聲峰相混,所以,在判斷分子離子峰時要綜合考慮樣品來源、性質等其他因素。


如果判斷沒有分子離子峰或分子離子峰不能確定,則需要采取軟電離方式,如化學電離源、場解吸源及電噴霧電離源等。要根據樣品特點選用合適的離子源。軟電離方式得到的往往是準分子離子,然后由準分子離子推斷出真正的分子量。



二、分子式的確定


利用一般的El質譜很難確定分子式。在早期,曾經有人利用分子離子峰的同位素峰來確定分子組成式。有機化合物分子都是由C、H、O、N等元素組成的,這些元素大多具有同位素,由于同位素的貢獻,質譜中除了有質量為M的分子離子峰外,還有質量為M+1、M+2的同位素峰。


由于不同分子的元素組成不同,不同化合物的同位素豐度也不同,貝農(Beynon)將各種化合物(包括C、H、O、N的各種組合)的M、M+1、M+2的強度值編成質量與豐度表,如果知道了化合物的分子量和M、M+1、M+2的強度比,即可查表確定分子式。


例如,某化合物分子量M=150(豐度100%), M+1的豐度為9.9%,M+2的豐度為0.88%,求化合物的分子式。根據Beynon表可知,M=150化合物有29個,其中與所給數據相符的為C9H10O2。這種確定分子式的方法要求同位素峰的測定十分準確。而且只適用于分子量較小,分子離子峰較強的化合物,如果是這樣的質譜圖,利用計算機進行庫檢索得到的結果一般都比較好,不需再計算同位素峰和查表。因此,這種查表的方法已經不再使用。


利用高分辨質譜儀可以提供分子組成式。因為碳、氫、氧、氮的原子量分別為12.000000、1.007825、15.994914、14.003074,如果能精確測定化合物的分子量,可以由計算機輕而易舉地計算出所含不同元素的個數。目前傅里葉變換質譜儀、雙聚焦質譜儀、飛行時間質譜儀等都能給出化合物的元素組成。



三、分子結構的確定


從前面的敘述可以知道,化合物分子電離生成的離子質量與強度,與該化合物分子的本身結構有密切關系。也就是說,化合物的質譜帶有很強的結構信息,通過對化合物質譜的解析,可以得到化合物的結構。


譜圖解析的一般流程


一張化合物的質譜圖包含有很多的信息,根據使用者的要求,可以用來確定分子量、驗證某種結構、確認某元素的存在,也可以用來對完全未知的化合物進行結構鑒定。對于不同的情況解析方法和側ZD不同。質譜圖一般的解析步驟如下:


(1)由質譜的高質量端確定分子離子峰,求出分子量,初步判斷化合物類型及是否含有CI、Br、S等元素。


(2)根據分子離子峰的高分辨數據,給出化合物的組成式。


(3)由組成式計算化合物的不飽和度,即確定化合物中環和雙鍵的數目。計算方法為:


例如,苯的不飽和度


不飽和度表示有機化合物的不飽和程度,計算不飽和度有助于判斷化合物的結構。


(4)研究高質量端離子峰。質譜高質量端離子峰是由分子離子失去碎片形成的。從分子離子失去的碎片,可以確定化合物中含有哪些取代基。常見的離子失去碎片的情況有:


(5)研究低質量端離子峰,尋找不同化合物斷裂后生成的特征離子和特征離子系列。例如,正構烷烴的特征離子系列為m/z 15、29、43、57、71等,烷基苯的特征離子系列為m/z91、77、65、39等。根據特征離子系列可以推測化合物類型。


(6)通過上述各方面的研究,提出化合物的結構單元。再根據化合物的分子量、分子式、樣品來源、物理化學性質等,提出一種或幾種Z可能的結構。必要時,可根據紅外光譜和核磁共振數據得出Z后結果。


(7)驗證所得結果。驗證的方法有:將所得結構式按質譜斷裂規律分解,看所得離子和所給未知物譜圖是否一致;查該化合物的標準質譜圖,看是否與未知譜圖相同;尋找標樣,做標樣的質譜圖,與未知物譜圖比較等各種方法。

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